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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Treinta y Tres. |
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Fecha : |
17/04/2017 |
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Actualizado : |
11/10/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
LAKIN, S.M.; DEAN, C.; NOYES, N.R.; DETTENWANGER, A.; ROSS, A. S.; DOSTER, E.; ROVIRA, P.J.; ABDO, Z.; JONES, K.L.; RUIZ, J.; BELK, K.E.; MORLEY, P.S.; BOUCHER, C. |
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Afiliación : |
STEVEN M. LAKIN; CHRIS DEAN; NOELLE R. NOYES; ADAM DETTENWANGER; ANNE SPENCER ROSS; ENRIQUE DOSTER; PABLO JUAN ROVIRA SANZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. Department of Animal Sciences, Colorado State University, USA.; ZAID ABDO; KENNETH L. JONES; JAIME RUIZ; KEITH E. BELK; PAUL S. MORLEY; CHRISTINA BOUCHER. |
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Título : |
MEGARes: an antimicrobial resistance database for high throughput sequencing. |
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Fecha de publicación : |
2017 |
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Fuente / Imprenta : |
Nucleic Acids Research, 2017 v.45 p.574-580. |
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DOI : |
10.1093/nar/gkw1009 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article History: Published online 2016 Nov 24.
DOI: https://doi.org/10.1093/nar/gkw1009 |
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Contenido : |
Antimicrobial resistance has become an imminent concern for public health. As methods for detection and characterization of antimicrobial resistance move from targeted culture and polymerase chain reaction to high throughput metagenomics, appropriate resources for the analysis of large-scale data are required. Currently, antimicrobial resistance databases are tailored to smaller-scale, functional profiling of genes using highly descriptive annotations. Such characteristics do not facilitate the analysis of large-scale, ecological sequence datasets such as those produced with the use of metagenomics for surveillance. In order to overcome these limitations, we present MEGARes (https://megares.meglab.org), a hand-curated antimicrobial resistance database and annotation structure that provides a foundation for the development of high throughput acyclical classifiers and hierarchical statistical analysis of big data. MEGARes can be browsed as a stand-alone resource through the website or can be easily integrated into sequence analysis pipelines through download. Also via the website, we provide documentation for AmrPlusPlus, a user-friendly Galaxy pipeline for the analysis of high throughput sequencing data that is pre-packaged for use with the MEGARes database. |
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Palabras claves : |
BASE DE DATOS; BIOINFORMÁTICA; DATASETS; DRUG RESISTANCE; GENES; METAGENÓMICA; METAGENOMICS; MICROBIAL; POLYMERASE CHAIN REACTION; PUBLIC HEALTH MEDICINE; RESISTENCIA ANTIMICROBIANA; SEQUENCE ANALYSIS. |
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Asunto categoría : |
L01 Ganadería |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/6677/1/Rovira-arb-2017-1.pdf
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5210519/
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Marc : |
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001 1057051
005 2019-10-11
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Registro original : |
INIA Treinta y Tres (TT) |
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Tipo / Formato
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Clasificación
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Registro
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Estado
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| Registros recuperados : 16 | |
| 2. |  | Telesca, J. Equipos de refrigeración y psicrometría ln: Carballo, S.; Feippe, A. (cords.). Actualización técnica en fisiología y manejo postcosecha de frutas y hortalizas. Canelones (Uruguay): INIA LB, 2003. p. 169-176 INIA Las Brujas| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 4. | | CARBALLO, S.; TELESCA, J. Validación de tecnologías de secado de cebollas. Resultados parciales de Proyecto MGAP-PROVA Nro.38. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); INIA Las Brujas; Programa Horticultura. Presentación de resultados experimentales en ajo y cebolla. Reunión de divulgación. Canelones (Uruguay): INIA, 2000. p. 36-42 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 223)| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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| 13. | | SCHENZER, D.; TELESCA, J.; CARBALLO, S.; CABOT, M. Curado y almacenamiento de cebolla en macrotúnel. Proyecto FPTA 86. Convenio INIA-Facultad de Ingeniería: Rediseño del sistema de curado macrotúnel para ajo, cebolla y boniato. In: INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria); INIA Las Brujas; Programa Horticultura. Presentación de resultados experimentales en ajo y cebolla. Reunión de divulgación. Canelones (Uruguay): INIA, 2000. p. 30-35 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 223)| Biblioteca(s): INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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| 15. | | CARBALLO, S.; CABOT, M.; PERRONE, R.; CAMPELO, E.; TELESCA, J. Fase piloto de secado de ajos en Canelón Grande ln: Reunión técnica sobre resultados experimentales en ajo, 1998, Las Brujas, Canelones (UY) Memorias. Las Brujas, Canelones (Uruguay): INIA, 1998. p. 25-27 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 162) INIA Las Brujas| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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| 16. | | Telesca, J.Carballo, S.Cabot, M.Schenzer, D. Optimización de un macrotúnel para curado de cebolla ln: Reunión Científica de Cebolla del Mercosur, 3., 1999, Salto, Uruguay Memorias. Montevideo (Uruguay): INIA, 1999. p. 118 Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Agronomía; Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, Uruguay| Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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